生態養魚一般可采用一次放養，捕撈的養殖制度。在生態養魚發展較快的淺水草型湖泊（千島湖）圍養區，可歸納為以下兩種放養模式：蝙魚、草魚為主占百分之十，搭配青魚百分之八、鯉魚百分之一（浙江地區不太喜歡這樣的魚類但是考慮到生態方式）。
螂魚百分之六、花白醚百分之五；鯉魚為主百分之四十，搭配草魚、編魚百分之三十、卿魚百分之八、花白鏈百分之八。在富營養或超富營養水體中，花白避、白娜、羅非魚等的放養比例可占1:1:1,鯉魚、草魚、編魚等占百分之二十。
隨著圍養技術的改進和提高，圍養區的放養規格趨向多樣化，一般草魚青魚種規格為六百到一千只：花白醚六十只；鯉、娜、編魚種一百只。搭建餌料臺搭建。常常下水前期重點觀察石籠能否入泥、吊空、移位，早晚巡網，發現問題及時修補。
在內外兩層墻網之間設置防逃察看籠梢，大型圍攔區分段設置，以便及時查出逃魚區段。和風細雨之后立刻觀察。每年冬捕完畢，魚種放養前，徹底清查、修補或更新石籠及網片。圍養區的草食場和精料臺應多點散布。草食場的面積宜大一些，框架必需可以隨水位漲落上下挪動。圍攔區套養魚種，要加設用網片隔開只能小魚進出的幼魚食臺。
